CulebrONT requirements
Suite demande https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-soft-pour-culebront/
J'ai opté pour installer les dépendances toutes dipsonibles via conda:
- nanopolish/0.13.2
- racon/1.4.20
- miniasm/0.3_r179
- smartdenovo/1.0.0
- minipolish/0.1.2
- shasta/0.6.0
- mauve/2.4.0.r4736
Le projet CulebrONT fournit également des images singularity, mais il m'a semblé préférable d'installer les dépendances via conda (permets d'utiliser les softs "unitairement" et j'ai pas bien compris l'objet de chaque image singularity).