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......@@ -35,7 +35,7 @@ La documentation est organisée en 5 sections :
- [Tables](tables/README.md) est un dictionnaire des tables et variables ;
- [Contribuer](contribuer/README.md) est un guide de contribution à cette documentation.
Chacune de ces sections correspond à un dossier sur [GitLab](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds), avec un [dossier supplémentaire](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds/files) pour les fichiers et images.
Chacune de ces sections correspond à un dossier sur [GitLab](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds), avec un [dossier supplémentaire](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds/-/tree/master/files) pour les fichiers et images.
## Citation
......
......@@ -22,7 +22,7 @@ La documentation est publiée par le Health data hub sous licence Mozilla Public
Un fichier licence est disponible sur Gitalb: [LICENSE](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds/blob/master/LICENSE).
Les programmes partagés sur le dépôt [Programme sur Gitlab](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns) sont publiés sous licence [APACHE-2.0](https://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0).
Les programmes partagés sur le dépôt [Programme sur Gitlab](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds) sont publiés sous licence [APACHE-2.0](https://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0).
## Partenaires
La documentation résulte d'une mise en commun de documents et travaux par plusieurs organisations, dont :
......
......@@ -31,7 +31,7 @@ La documentation est organisée en 5 sections disponible dans le menu de droite
- [Tables](../../tables/README.md) est un dictionnaire des tables et variables ;
- [Contribuer](../../contribuer/README.md) est un guide de contribution à cette documentation.
Chacune de ces sections correspond à un dossier sur [GitLab](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds), avec un [dossier supplémentaire](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds/files) pour les fichiers et images.
Chacune de ces sections correspond à un dossier sur [GitLab](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds), avec un [dossier supplémentaire](https://gitlab.com/healthdatahub/documentation-snds/-/tree/master/files) pour les fichiers et images.
### Naviguer sur le site
......
......@@ -51,7 +51,7 @@ Utiliser le document CodiMD partagé, en suivant lien donné en formation.
1. Se connecter à [gitlab.com](https://gitlab.com/).
1. Aller sur le projet Gitlab `programmes-SNDS` : [gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns)
1. Aller sur le projet Gitlab `programmes-SNDS` : [gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds)
- Combien d'organisations ont partagé des programmes sur ce projet ?
- Quand a été créé le dossier de Santé publique France ?
......@@ -212,7 +212,7 @@ Exemple : `[CMU-C](../fiches/cmu_c.md)` pour [CMU-C](../../fiches/cmu_c.md)
## TP 8 : Ajouter des programmes
TP optionnel :
- Créer un dossier pour votre organisation dans le projet [programmes-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns)
- Créer un dossier pour votre organisation dans le projet [programmes-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds)
- Ajouter un README selon les consignes du fichier CONTRIBUTING.md
- Ajouter un programme documenté
......
......@@ -24,7 +24,7 @@ Le partage de programmes ou scripts d'analyses est très utile pour la communaut
Dans les fiches de courtes sections de code sont souvent partagées.
Les programmes plus conséquents, par exemple un script complet d'analyse, sont partagés dans le dépôt dédié [programme-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns). Les programmes partagés dans ce dépôt dédié sont sous licence APACHE 2.0. Une [fiche](../../ressources/programmes.md) les répertoriant est disponible sur le site de la documentation.
Les programmes plus conséquents, par exemple un script complet d'analyse, sont partagés dans le dépôt dédié [programme-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds). Les programmes partagés dans ce dépôt dédié sont sous licence APACHE 2.0. Une [fiche](../../ressources/programmes.md) les répertoriant est disponible sur le site de la documentation.
## Comment créer un nouveau dossier
Pour créer un nouveau dossier, naviguer dans le dossier de votre choix, et sélectionnez **Nouveau dossier** dans le menu déroulant `+`.
......
......@@ -136,7 +136,7 @@ Résultat : [Lien vers la page de la table ER_PRS_F](/tables/ER_PRS_F)
:::
### Inclure une image
Pour inclure une image, il faut tout d'abord la téléverser dans Gitlab (voir fiche [Ajouter des fichiers](https://documentation-snds.health-data-hub.fr/contribuer/nouveau_fichier.html)).
Pour inclure une image, il faut tout d'abord la téléverser dans Gitlab (voir fiche [Partage document](partage_document.md)).
1. Pour afficher une image, ajouter un **point d'exclamation** devant son chemin ou son URL.
......
......@@ -56,7 +56,7 @@ Le [partage de programmes](Guide_contribution/partage_document.md#partage-de-pro
Nous partageons dans les fiches de courtes sections de code illustratives.
Les programmes plus conséquents, par exemple un script complet d'analyse, sont partagés dans le dépôt dédié [programme-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns).
Les programmes plus conséquents, par exemple un script complet d'analyse, sont partagés dans le dépôt dédié [programme-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds).
::: tip Pour Info
......
......@@ -99,7 +99,7 @@ PROC SQL;
;
QUIT;
```
La variable `tip_ord_num` donne le nombre de ligne de la table affinée correspondant à une ligne dans la table prestation. Lorsque `tip_ord_num` est supérieur à 1, cela signifie que pour une ligne de la table prestation, on a `n` lignes sur la table affinée.
La variable `tip_ord_num` donne le nombre de lignes de la table affinée correspondant à une ligne dans la table prestation. Lorsque `tip_ord_num` est supérieur à 1, cela signifie que pour une ligne de la table prestation, on a `n` lignes sur la table affinée.
Il faut donc être prudent, car les informations de la table prestations sont dupliquées sur ces lignes. Notamment le montant de l'acte qui se trouve dans la table prestation.
......
......@@ -6,4 +6,4 @@ La Caisse nationale d'assurance vieillesse (Cnav) gère la retraite des salarié
# Références
- [Page wikipedia](https://fr.wikipedia.org/wiki/Caisse_nationale_d%27assurance_vieillesse)
- Présentation sur le site internet de [l'assurance retraite](https://www.lassuranceretraite.fr/portail-info/hors-menu/footer/qui-sommes-nous.html)
\ No newline at end of file
- Présentation sur le site internet de [l'assurance retraite](https://www.lassuranceretraite.fr/portail-info/hors-menu/footer/nous-connaitre.html)
\ No newline at end of file
......@@ -6,36 +6,36 @@ Cette page référence des dépôt public de programmes sur le SNDS dont le code
## Dépôt commun
Le dépôt [programmes-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns) héberge des programmes produits par différentes organisations, et partagés sous licence `Apache-2.0`. Il est maintenu par le Health Data Hub.
Le dépôt [programmes-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds) héberge des programmes produits par différentes organisations, et partagés sous licence `Apache-2.0`. Il est maintenu par le Health Data Hub.
Le README principal explique l'organisation du dépôt.
Le document [CONTRIBUTING.md](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/blob/master/CONTRIBUTING.md) explique les bonnes pratiques pour contribuer à ce dépôt.
Le document [CONTRIBUTING.md](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/blob/master/CONTRIBUTING.md) explique les bonnes pratiques pour contribuer à ce dépôt.
## Liste des programmes disponibles
Tous les programmes disponible sur [programme-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/tree/master) sont sous [licences Apache 2.0](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/LICENSE) et proviennent de contributions de l’écosystème.
Tous les programmes disponibles sur [programme-snds](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/tree/master) sont sous [licences Apache 2.0](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/LICENSE) et proviennent de contributions de l’écosystème.
### Agence Régional de Santé (ARS) Normandie et Centre Val de Loire
- Programme d’[estimation du non recours à partir de la méthodologie de l’observatoire des fragilités](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/ARS/Recours%20ou%20non-recours%20aux%20soins/NORMANDIE_estimation_nonrecours.sas) par Céline Leroy de l’ARS Normandie
- Programme d’[estimation du non recours à partir de la méthodologie de l’observatoire des fragilités](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/ARS/Recours%20ou%20non-recours%20aux%20soins/NORMANDIE_estimation_nonrecours.sas) par Céline Leroy de l’ARS Normandie
- Programme d’[Estimation du taux de recours par commune au Médecins Généralistes - MG - sur 2017](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/ARS/Recours%20ou%20non-recours%20aux%20soins/tx_recours_mg.sas) par Céline Leroy (ARS NORM.) & Jérôme Brocca (ARS CVL)
- Programme d’[Estimation du taux de recours par commune au Médecins Généralistes - MG - sur 2017](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/ARS/Recours%20ou%20non-recours%20aux%20soins/tx_recours_mg.sas) par Céline Leroy (ARS NORM.) & Jérôme Brocca (ARS CVL)
- Programme ALD sur [ALZHEIMER](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/ARS/pathologies/ALD/ALD.sas) par Céline Leroy (ARS NORM.) & Jérôme Brocca (ARS CVL)
- Programme ALD sur [ALZHEIMER](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/ARS/pathologies/ALD/ALD.sas) par Céline Leroy (ARS NORM.) & Jérôme Brocca (ARS CVL)
- Dossier avec 3 programmes permettant l'estimation de la prévalence des pathologies à partir des tables de cartographie des pathologies & dénombrement de population protégée, proposé par l’ARS Normandie.
- [cartographie des pathologies](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/ARS/pathologies/carto%20patho/NORMANDIE_carto_patho.sas)
- [dénominateur national](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/ARS/pathologies/carto%20patho/NORMANDIE_denominateur_national.sas)
- [Estimation de la population protégée Régime Général et Section Locale Mutualiste - RG+SLM](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/ARS/pathologies/carto%20patho/NORMANDIE_estimation_pop_prot_correction_patho.sas)
- [cartographie des pathologies](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/ARS/pathologies/carto%20patho/NORMANDIE_carto_patho.sas)
- [dénominateur national](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/ARS/pathologies/carto%20patho/NORMANDIE_denominateur_national.sas)
- [Estimation de la population protégée Régime Général et Section Locale Mutualiste - RG+SLM](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/ARS/pathologies/carto%20patho/NORMANDIE_estimation_pop_prot_correction_patho.sas)
### Centre d’épidémiologie et de santé publique des armées (CESPA) du Service de Santé des Armées (SSA)
- Programme de [Reperage des Rhabdomyolyse d’effort en 2016](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/SSA-CESPA/Rhabdomyolise_09012020.sas). Pour toutes informations sur ce programme, vous pouvez contacter [Bakridine Mmadi-Mrenda](mailto:bakridine.mmadi-mrenda@intradef.gouv.fr)
- Programme de [Reperage des Rhabdomyolyse d’effort en 2016](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/SSA-CESPA/Rhabdomyolise_09012020.sas). Pour toutes informations sur ce programme, vous pouvez contacter [Bakridine Mmadi-Mrenda](mailto:bakridine.mmadi-mrenda@intradef.gouv.fr)
### Santé Publique France (SPF)
Ces programmes sont présents dans le dossier Santé Publique France dont le détail est disponible dans le [readme](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/Sante_publique_France/README.md) dédié.
Ces programmes sont présents dans le dossier Santé Publique France dont le détail est disponible dans le [readme](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/Sante_publique_France/README.md) dédié.
- Programme de [sélection de données socio-démographiques dans les référentiels des bénéficiaires](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/Sante_publique_France/infos_socio_eco_referentiels_dcir.sas)
- Programme de [sélection des remboursements de médicaments dans le DCIR archive et le DCIR](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/Sante_publique_France/prestations_medicaments_DCIR.sas)
- Programme de [sélection des hospitalisations MCO en fonction des DP ou DR ou DAS incluant des variables relatives au patient, au séjour et à l’établissement de santé](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-sdns/-/blob/master/Sante_publique_France/sejours_pmsi_mco.sas)
- Programme de [sélection de données socio-démographiques dans les référentiels des bénéficiaires](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/Sante_publique_France/infos_socio_eco_referentiels_dcir.sas)
- Programme de [sélection des remboursements de médicaments dans le DCIR archive et le DCIR](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/Sante_publique_France/prestations_medicaments_DCIR.sas)
- Programme de [sélection des hospitalisations MCO en fonction des DP ou DR ou DAS incluant des variables relatives au patient, au séjour et à l’établissement de santé](https://gitlab.com/healthdatahub/programmes-snds/-/blob/master/Sante_publique_France/sejours_pmsi_mco.sas)
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