R

R

This project is for educational purposes only.

Some very basic intro to ggplot2

R package to access the API of ACLED and retrieve conflict event data.

My solutions to the Advent of Code in (mostly) base R

EDA on Airline On-Time Performance on 2013 data

R package for the validation of air quality and meteorology simulations.

For more information see the documentation.

A docker image of Alpine Linux with R pre-installed

Docker image based on Alpine Linux with R and RMarkdown dependencies pre-installed

Le projet est réalisé par ALVAREZ Océane et IBRAHIM Benita, étudiantes en M1 Bio-informatique parcours BBS (Bio-informatique et biologie des Systèmes) de l'Université de Toulouse. Ce projet de fouille de données est un projet réalisé dans le cadre de l'UE : Fouille de données, dirigée par Mr. Roland Barriot : @rbarriot.

Durant cette étude des analyses seront effectuées sur R en fonction d'un dataset choisi. Le projet se décomposera en trois parties : La première consistera en une analyse exploratoire complète du jeu de données enfin d'en comprendre la structure. La seconde correspondra à la phase de conception, durant laquelle une réflexion sera menée sur les méthodes d’analyse à mettre en œuvre et sur les objectifs à poursuivre. Enfin, la troisième partie portera sur la mise en œuvre des analyses choisies, accompagnée d'une évaluation des résultats qui seront obtenus et d'une discussion sur de potentielles améliorations.

En raison d'une appétence particulière pour le domaine de la santé, le choix s'est orienté sur un dataset relatif aux maladies cardiovasculaires. Pour plus d’informations sur les données, consultez la section dédiée et le README.md explicatif : https://gitlab.com/alvarez_oceane/fouille-projet/-/tree/master/data

L'objectif de notre étude est d'obtenir et d’identifier une ou plusieurs méthodes de classification supervisée capables de prédire correctement le type de douleur thoracique à partir des variables cliniques disponibles dans le dataset. Plusieurs méthodes seront comparées comme Naive Bayes, K-NN, LDA et Random Forest. L’obtention d’un ou plusieurs modèles fiables pour prédire correctement la classe des patients à partir des variables explicatives est attendu. Tout comme la visualisation des performances des modèles et la sélection du modèle final le plus pertinent.

Les codes, le rapport et chaque Rmd utilisé lors de l'étude sont disponibles sur ce git.

An R package to simplify the analysis and prediction of Antimicrobial Resistance (AMR) and to work with antibiotic data by using evidence-based methods.

Andreas' collection of miscellaneous small convenience functions

Dépôt à disposition des participants de l'ANF CNRS « Rendre sa recherche plus transparente, optimiser ses processus en science des données ». (Miroir depuis gitub.u-bordeaux.fr)

Dépôt pour le site web de l'Action nationale de formation CNRS "ERIC". Website.

Matériel à disposition des participants pour l'atelier d'analyse de données sur le Goldman Data Set.

An R package for Smith's Mean Measure of Divergence (MMD), with a graphical user interface, facilities for trait selection and graphical representations. doi:10.1002/ajpa.23336

A set of useful R functions for biological anthropology and past sciences.

Shoot a JupyterLab | marimo | VS Code/VSCodium | Pluto.jl | Matlab | SSHD | ... server to a (remote) Slurm allocation and talk to it via your local browser. Runs locally (Linux, Mac, Windows (WSL)) or remotely (e.g. as Remote or ProxyCommand configured in ~/.ssh/config) or inside an interactive Slurm session. One Bash script for both tasks: as a wrapper it starts itself as an sbatch script in a Slurm job.

Datasets and R source code of manuscript by Depeux et al. (2022) on the effects of temperature and moisture stresses on life history traits and individual quality biomarkers in the arthropod Armadillidium vulgare