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4. 在R语言环境下运行 `chooseBioCmirror(local.only=T)`,(注意参数不可省略),选择“8: (other mirrors)”后,出现 “9: China (Xi'an) [https]”,则为开源社区的镜像 4. 在R语言环境下运行 `chooseBioCmirror(local.only=T)`,(注意参数不可省略),选择“8: (other mirrors)”后,出现 “9: China (Xi'an) [https]”,则为开源社区的镜像
# 超算中心重置镜像路径 # 超算中心重置镜像路径
1. 打开Rprofile文件,文件路径 R安装目录/lib[或lib64]/R/library/base/R/Rprofile 1. 打开 `BioC_mirrors.csv` 文件,文件路径为`R安装路径/doc/BioC_mirrors.csv` 将下列语句粘贴在文件末尾
2. 在文件末尾加入默认CRAN路径位置 `China (Xi'an) [https],China,Xi'an,https://202.117.120.246/mirrors/bioc/,"Xidian University","Xidian University Open Source Community",1,cn`
`local({r <- getOption("repos")` 2. 打开 `CRAN_mirrors.csv` 文件,文件路径为`R安装路径/doc/BioC_mirrors.csv` 将下列语句粘贴在文件末尾
` r["CRAN"] <- "202.117.120.246/mirrors/CRAN/"` `"China (Xi'an) [https]",China,Xi'an,https://202.117.120.246/mirrors/CRAN/,"Xidian University","Xidian University Open Source Community",1,cn`
` options(repos=r)` 3. 安装所需的包时,先运行`chooseCRANmirror(local.only=T)``chooseBioCmirror(local.only=T)`,分别选择“China (Xi'an)”作为所用源,即可使用开源社区的镜像
` })` 4. 当前问题是,超算中心无法正常安装BioInstaller包。
> 其中的ip为linux.xidian.edu.cn的ip
3.