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4.
在R语言环境下运行
`chooseBioCmirror(local.only=T)`
,(注意参数不可省略),选择“8: (other mirrors)”后,出现 “9: China (Xi'an) [https]”,则为开源社区的镜像
4.
在R语言环境下运行
`chooseBioCmirror(local.only=T)`
,(注意参数不可省略),选择“8: (other mirrors)”后,出现 “9: China (Xi'an) [https]”,则为开源社区的镜像
# 超算中心重置镜像路径
# 超算中心重置镜像路径
1.
打开Rprofile文件,文件路径 R安装目录/lib[或lib64]/R/library/base/R/Rprofile
1.
打开
`BioC_mirrors.csv`
文件,文件路径为
`R安装路径/doc/BioC_mirrors.csv`
将下列语句粘贴在文件末尾
2.
在文件末尾加入默认CRAN路径位置
`China (Xi'an) [https],China,Xi'an,https://202.117.120.246/mirrors/bioc/,"Xidian University","Xidian University Open Source Community",1,cn`
`local({r <- getOption("repos")`
2.
打开
`CRAN_mirrors.csv`
文件,文件路径为
`R安装路径/doc/BioC_mirrors.csv`
将下列语句粘贴在文件末尾
` r["CRAN"] <- "202.117.120.246/mirrors/CRAN/"`
`"China (Xi'an) [https]",China,Xi'an,https://202.117.120.246/mirrors/CRAN/,"Xidian University","Xidian University Open Source Community",1,cn`
` options(repos=r)`
3.
安装所需的包时,先运行
`chooseCRANmirror(local.only=T)`
和
`chooseBioCmirror(local.only=T)`
,分别选择“China (Xi'an)”作为所用源,即可使用开源社区的镜像
` })`
4.
当前问题是,超算中心无法正常安装BioInstaller包。
> 其中的ip为linux.xidian.edu.cn的ip
3.