Change CreateOrOverwriteLayer for CreateOrOverwriteFile só que no meu teste o código não juntou todas as layers abertas no projeto apenas criou um GPKG com uma delas

Tive de fazer uma verificação se o arquivo existia para usar uma opção diferente.

Estava testando aqui, fazendo também esta verificação e substituindo o -'CreateOrOverwriteFile' por AppendToLayerAddFields ou AppendToLayerAddFieldsmas não deu um resultado satisfatório

Testei esta solução continuou retornando um GPKG com apenas uma das feições do projeto.